Храм Ком-Омбо, построенный в греко-римский период, живописно расположен на холме. Он имеет те же элементы, что и другие храмы: открытый двор, обрамленный колоннами, два гипостильных зала. Однако это не совсем обычный храм, он посвящен одновременно двум богам: Себеку, изображаемому с головой крокодила, и сокологоловому старшему брату Осириса - Хору. Поэтому храм имеет не одно, а два святилища. Святилище Хора находится в северной части храма, а святилище Себека - в южной. Большинство рельефов выполнено при Птолемее XП (80-58 гг. до н.э.). Барельефы храма изображают очищение этого правителя храмовыми божествами. На стенах храма также можно увидеть удивительно точное воспроизведение медицинских инструментов. Это еще раз подтверждает то, что древние египтяне владели тайнами врачевания.